Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RpainQ9CWY9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RpainQ9CWY9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RpainQ9CWY9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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