Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chchd3Q9CRB9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chchd3Q9CRB9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Chchd3Q9CRB9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chchd3Q9CRB9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms