Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cox6cQ9CPQ1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cox6cQ9CPQ1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cox6cQ9CPQ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6cQ9CPQ1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6cQ9CPQ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cox6cQ9CPQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox6cQ9CPQ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox6cQ9CPQ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox6cQ9CPQ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox6cQ9CPQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox6cQ9CPQ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cox6cQ9CPQ1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cox6cQ9CPQ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox6cQ9CPQ1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cox6cQ9CPQ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
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