Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClmpQ8R373 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClmpQ8R373 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClmpQ8R373 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClmpQ8R373 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms