Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hpf1Q8CFE2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hpf1Q8CFE2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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