Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7M3

Trim9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim9Q8C7M3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim9Q8C7M3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim9Q8C7M3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim9Q8C7M3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim9Q8C7M3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim9Q8C7M3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim9Q8C7M3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim9Q8C7M3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms