Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabra5Q8BHJ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra5Q8BHJ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabra5Q8BHJ7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gabra5Q8BHJ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms