Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc4Q8BG19 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmtc4Q8BG19 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmtc4Q8BG19 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmtc4Q8BG19 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms