Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2d2bQ6ZWY6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube2d2bQ6ZWY6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube2d2bQ6ZWY6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms