Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx13Q6PHS6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx13Q6PHS6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx13Q6PHS6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx13Q6PHS6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms