Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nr2f1Q60632 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr2f1Q60632 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr2f1Q60632 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr2f1Q60632 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms