Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Clec4a4Q5YIR8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4a4Q5YIR8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clec4a4Q5YIR8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clec4a4Q5YIR8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms