Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfsf15Q5UBV8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfsf15Q5UBV8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 666.7 ms