Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zkscan4Q5SZT6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zkscan4Q5SZT6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zkscan4Q5SZT6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan4Q5SZT6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan4Q5SZT6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan4Q5SZT6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Zkscan4Q5SZT6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms