Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sft2d1Q5SSN7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d1Q5SSN7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sft2d1Q5SSN7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.9 ms