Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap5b1Q3TAP4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ap5b1Q3TAP4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ap5b1Q3TAP4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms