Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NKPD1Q17RQ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NKPD1Q17RQ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKPD1Q17RQ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms