Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMPG1Q17R60 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IMPG1Q17R60 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMPG1Q17R60 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IMPG1Q17R60 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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