Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atf4Q06507 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atf4Q06507 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms