Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp39Q02525 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zfp39Q02525 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp39Q02525 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp39Q02525 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms