Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF9Q00978 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRF9Q00978 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRF9Q00978 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms