Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pkn1P70268 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pkn1P70268 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pkn1P70268 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pkn1P70268 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 376.1 ms