Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxc5P32043 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxc5P32043 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms