Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms