Protein–RNA interactions for Protein: P0DP60

Lynx1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lynx1P0DP60 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lynx1P0DP60 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lynx1P0DP60 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lynx1P0DP60 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms