Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt10P02535 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt10P02535 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt10P02535 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt10P02535 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt10P02535 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt10P02535 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt10P02535 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt10P02535 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt10P02535 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt10P02535 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt10P02535 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt10P02535 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt10P02535 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt10P02535 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms