Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp8O89110 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp8O89110 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Casp8O89110 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp8O89110 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Casp8O89110 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp8O89110 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp8O89110 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp8O89110 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp8O89110 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp8O89110 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Casp8O89110 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp8O89110 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms