Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm379J3QQ19 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Gm379J3QQ19 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Gm379J3QQ19 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Gm379J3QQ19 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Gm379J3QQ19 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Gm379J3QQ19 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Gm379J3QQ19 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Gm379J3QQ19 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Gm379J3QQ19 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Gm379J3QQ19 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Gm379J3QQ19 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Gm379J3QQ19 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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