Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm20547B8JJN0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm20547B8JJN0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm20547B8JJN0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm20547B8JJN0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms