Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERINC1Q9NRX5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms