Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CNTNAP4Q9C0A0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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