Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BCO2Q9BYV7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms