Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LRRC3Q9BY71 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms