Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC38A2Q96QD8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms