Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK2A3Q8NEV1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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