Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RHOT1Q8IXI2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHOT1Q8IXI2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms