Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
OTOP1Q7RTM1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms