Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD54Q6NXT1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms