Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GARNL3Q5VVW2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GARNL3Q5VVW2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms