Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Slc5a6Q5U4D8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Slc5a6Q5U4D8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Slc5a6Q5U4D8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Slc5a6Q5U4D8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Slc5a6Q5U4D8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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