Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD1Q5SYB0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms