Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms