Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms