Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDO1Q16878 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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