Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GABRA6Q16445 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GABRA6Q16445 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA6Q16445 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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