Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFIXQ14938 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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