Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NUP160Q12769 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP160Q12769 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms