Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RASGEF1BQ0VAM2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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