Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OTUD4Q01804 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms