Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP6P59044 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP6P59044 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms